《医学发明》所论以《黄帝内经》为宗，重点论述五脏疾病的证治。除了淳淳于“人以胃气为本”之外，对于虚损之用补肾益精，肺虚寒饮之用益气温肺化饮等等，亦多所阐发。东垣著名的“中风论”即见于本书：“中风者，非外来风邪。乃本气病也。凡人年逾四旬，气衰之际，或忧喜忿怒，伤其气者，多有此病。壮岁之时无有也，若肥盛则间有之，亦形盛气衰如此。"全书列方73首。比较全面地反映了东垣的学术成就。
《活法机要》之成书，据《中国医籍考》载：“（东垣）著作甚多，惟有《药用珍珠囊》、《脾胃论》……《五经活法机要》、《兰室秘藏》……等书刊行。”任应秋氏在《中医各家学说》东垣所著书目中亦列出《活法机要》一书。是书列临证20门，涉及内、外、妇、眼、皮肤各科。对病因、病机、症状鉴别作了详细论述，对疾病的轻重缓急，用方加减，引经配伍亦有交代，体现了立法定方之“圆机活法”。
医学发明
膈咽不通并四时换气
用药法
吴茱萸丸
利膈丸
消痞丸
黄芪补中汤
本草十剂
中风同从高坠下
伤元活血汤
乳香神应散
当归导滞散
紫金丹
圣灵丹
凡卫气留于腹中，积蓄不行。脉弦急及腹皮急，菀蕴不得常所，支胁胃中满，喘呼逆息者
调中顺气丸
沉香导气散
本香顺气汤
沉香交泰丸
呕咳气喘
加减泻白散
神秘汤
加减三奇汤
饮食劳倦论
补中益气汤
朱砂安神丸
四时用药加减法
人参益肺散
通风防风汤
草豆蔻丸
白术附子汤
滑脉生癫疝
丁香楝实丸
天台乌药散
茴香楝实丸
川苦楝散
泻之则胀已汗之则疮已
托里营卫汤
……
活法机要
兰室秘藏
